Skip to main content
web hosting indonesia

Jenis Microarray

Microarray atau biochip adalah slide mikroskop yang berorientasi lab yang biasanya terbuat dari kaca, chip silikon, atau membran nilon. Ini adalah array 2D (kadang-kadang 3D) yang permukaannya dilengkapi dengan ribuan pori-pori menit di posisi yang ditentukan.

Microarray adalah teknologi yang baru dikembangkan dan baru ditemukan dua dekade yang lalu. Hal ini banyak digunakan dalam penelitian kanker dan dalam pengobatan farmakologis penyakit lain seperti lesi oral. Ini memungkinkan peneliti untuk menyelidiki dan menganalisis ekspresi ribuan gen dalam satu reaksi dan mengatasi berbagai disfungsi.

Teknologi ini bekerja di bawah prinsip mengikat (hibridisasi) untaian urutan DNA komplementer (cDNA) satu sama lain. Microarray memiliki dua klasifikasi luas, berdasarkan pada mode persiapan dan jenis probe yang digunakan.

Klasifikasi microarray berdasarkan cara persiapan
Berdasarkan cara penyusunan array, microarray dibagi menjadi tiga jenis:

  • Array yang terlihat pada kaca: array bertali adalah susunan yang dibuat pada slide mikroskop kaca berlapis polietil lisosa. Ini memberikan pengikatan DNA dengan kepadatan tinggi dengan menggunakan pin slotted. Ini memungkinkan pelabelan neon sampel.
  • Array yang dirakit sendiri: ini adalah susunan serat optik yang dibuat oleh pengendapan DNA yang disintesis pada manik polistiren kecil. Manik-manik diendapkan pada ujung-ujung array yang terukir. DNA yang berbeda dapat disintesis pada manik-manik yang berbeda dan menerapkan campuran manik-manik ke kabel serat optik akan membuat rangkaian rakitan secara acak.
  • In-situ disintesis array: array ini dibuat oleh sintesis kimia pada substrat padat. Dalam sintesis kimia, kelompok pelindung fotolabil digabungkan dengan fotolitografi untuk melakukan aksinya. Array ini digunakan dalam analisis ekspresi, genotip, dan sekuensing.

 

Klasifikasi microarray berdasarkan jenis probe yang digunakan

Berdasarkan jenis probe yang digunakan, microarray terdiri dari dua belas jenis:

  1. Mikroarray DNA: DNA microarray juga dikenal sebagai chip gen, chip DNA, atau biochip. Ini mengukur DNA atau menggunakan DNA sebagai bagian dari sistem pendeteksiannya. Ada empat jenis microarray DNA: microarray cDNA, microarrays DNA oligo, microarray BAC dan microarray SNP.
  2. MMChips: MMchip memungkinkan analisis integratif data cross-platform dan antar laboratorium. Ini mempelajari interaksi antara DNA dan protein. ChIP-chip (Chromatin immunoprecipitation (ChIP) diikuti oleh hibridisasi array) dan ChIP-seq (ChIP diikuti dengan sekuensing paralel secara besar-besaran) adalah dua teknik yang digunakan.
  3. Mikroarray protein: ia bertindak sebagai platform untuk karakterisasi ratusan ribu protein dengan cara yang sangat paralel. Protein microarray terdiri dari tiga jenis, dan ini adalah mikroarray protein analitik, microarray protein fungsional dan protein melingkar fase mikro.
  4. Mikroarray peptida: jenis array ini digunakan untuk analisis terperinci atau optimalisasi interaksi protein-protein. Ini membantu dalam pengenalan antibodi dengan skrining proteomes.
  5. Jaringan mikroarray: blokamen para parasitar jaringan mikro yang dibentuk dengan memisahkan inti jaringan silinder dari berbagai donor dan menyematkannya ke dalam satu microarray tunggal. Hal ini terutama digunakan dalam patologi.
  6. Mikroarray seluler: mereka juga disebut microarray transfeksi atau microarray sel hidup, dan digunakan untuk skrining perpustakaan kimia dan genom berskala besar dan secara sistematis menyelidiki lingkungan mikro seluler setempat.
  7. Senyawa mikroarray kimia: ini digunakan untuk skrining obat dan penemuan obat. Microarray ini memiliki kapasitas untuk mengidentifikasi dan mengevaluasi molekul kecil sehingga lebih bermanfaat daripada teknologi lain yang digunakan dalam industri farmasi.
  8. Mikroarray antibodi: mereka juga disebut sebagai rangkaian antibodi atau chip antibodi. Ini adalah mikroarray khusus protein yang mengandung kumpulan antibodi penangkapan yang ditempatkan di dalam slide mikroskop. Mereka digunakan untuk mendeteksi antigen.
  9. Array karbohidrat: mereka juga disebut glycoarrays. Array karbohidrat digunakan dalam protein skrining yang mengikat karbohidrat. Mereka juga dapat digunakan untuk menghitung afinitas ikatan protein dan otomasi sintesis pendukung-solid untuk glikol.
  10. Mikroarray fenotip: microarray fenotip atau PM terutama digunakan dalam pengembangan obat. Mereka secara kuantitatif mengukur ribuan fenotip seluler sekaligus. Ini juga digunakan dalam genomik fungsional dan pengujian toksikologi.
  11. Protein mikroase fase balik: mikroarray lisat atau serum. Sebagian besar digunakan dalam uji klinis, terutama di bidang kanker, mereka juga memiliki kegunaan farmasi. Dalam beberapa kasus, mereka juga dapat digunakan dalam studi biomarker.
  12. Sensor pencitraan pantulan interferometri atau IRIS: IRIS adalah biosensor yang digunakan untuk menganalisis interaksi protein-protein, protein-DNA, dan DNA-DNA. Itu tidak memanfaatkan label neon. Ini terbuat dari substrat Si / SiO2 yang disiapkan oleh tempat robotik.

 

Reviewed by: Dr Tomislav Meštrović, MD, PhD

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *